Les communautés de pleine mer, ou pélagiques, vivent dans la colonne d’eau. Les études du GIS Éolien en Mer portent sur les espèces dérivant avec les courants (phytoplancton et zooplancton) ou étant capables de lutter contre les courants : les céphalopodes et les poissons. Les ressources halieutiques, c’est-à-dire les espèces exploitées par la pêche ou l’aquaculture, se retrouvent principalement dans ces communautés de pleine mer.